|
|
@@ -1,4 +1,6 @@ |
|
|
|
#+TITLE: TD i2b2 |
|
|
|
#+author: Maxime Wack et Anne-Sophie Jannot |
|
|
|
#+date: 24 novembre 2020 |
|
|
|
|
|
|
|
* Installation |
|
|
|
|
|
|
@@ -8,18 +10,22 @@ https://www.i2b2.org/software/index.html |
|
|
|
|
|
|
|
** Télécharger VMware Player |
|
|
|
|
|
|
|
https://my.vmware.com/en/web/vmware/free#desktop_end_user_computing/vmware_workstation_player/15_0 |
|
|
|
https://www.vmware.com/products/workstation-player.html |
|
|
|
|
|
|
|
** Virtualbox |
|
|
|
|
|
|
|
Ouvrir vm vmware avec virtualbox |
|
|
|
Il est également possible de lire la vm vmware avec virtualbox |
|
|
|
Il faut cependant créer un réseau virtuel pour avoir accès aux IP internes |
|
|
|
|
|
|
|
*** Créer un réseau NATé |
|
|
|
|
|
|
|
File -> Host Network Manager |
|
|
|
Ajouter l'interface à la VM |
|
|
|
Créer un nouveau réseau |
|
|
|
Ajouter l'interface à la VM dans les options réseau |
|
|
|
|
|
|
|
* Lancement |
|
|
|
|
|
|
|
Charger la vm i2b2 dans VMware Workstation Player\\ |
|
|
|
Charger la vm i2b2 dans VMware Workstation Player |
|
|
|
Suivre les instructions pour l'accès à l'interface web en mode /demo/ et /admin/. |
|
|
|
|
|
|
|
* Connexion via SSH |
|
|
@@ -120,6 +126,7 @@ https://www.postgresql.org/docs/9.0/functions-aggregate.html |
|
|
|
- Nombre de patients masculins avec une néoplasie ? |
|
|
|
- Descriptif de cette population ? |
|
|
|
- Nombre de ces patients avec une CRP >= 3mg/l ? |
|
|
|
|
|
|
|
* Import/export |
|
|
|
|
|
|
|
Copie entre bdd et fichiers. |
|
|
|