diff --git a/NAMESPACE b/NAMESPACE
index 9294b2b..322486c 100644
--- a/NAMESPACE
+++ b/NAMESPACE
@@ -1,3 +1,5 @@
+# Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
+
S3method("label<-",data.frame)
S3method("label<-",default)
S3method(label,default)
diff --git a/R/desc_global.R b/R/desc_global.R
index 05dfdb0..1813b7e 100644
--- a/R/desc_global.R
+++ b/R/desc_global.R
@@ -248,10 +248,7 @@ diagnostic <- function(table, variables=NULL, variables_neg=NULL)
inc()
HTML("
", paste("", names(summary(table[[var]])), " | ", collapse=""), "
")
HTML("", sep="")
- for (valeur in summary(table[[var]]))
- {
- HTML("", valeur, " | ", sep="")
- }
+ HTML("",summary(table[[var]])," | ",sep="")
HTML("
")
dec()
HTML("")
diff --git a/man/HTML.Rd b/man/HTML.Rd
index 73ecae8..23dcbb1 100644
--- a/man/HTML.Rd
+++ b/man/HTML.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{HTML}
\alias{HTML}
@@ -6,21 +7,18 @@
HTML(x, ..., append = T, sep = "\\n")
}
\arguments{
- \item{x}{Contenu a ecrire}
+\item{x}{Contenu a ecrire}
- \item{...}{Contenu concatene sans espace a x}
+\item{...}{Contenu concatene sans espace a x}
- \item{append}{Decide si x... doit etre ajoute a un
- fichier existant}
+\item{append}{Decide si x... doit etre ajoute a un fichier existant}
- \item{sep}{Separateur de fin de ligne, modifier pour
- ecrire sur la meme ligne du fichier}
+\item{sep}{Separateur de fin de ligne, modifier pour ecrire sur la meme ligne du fichier}
}
\description{
Ecrit dans le fichier HTML cree par HTMLInit
}
\details{
-Ecrit dans le fichier initialise par HTMLInit dont le nom
-est contenu dans .HTML.file
+Ecrit dans le fichier initialise par HTMLInit dont le nom est contenu dans .HTML.file
}
diff --git a/man/HTMLEnd.Rd b/man/HTMLEnd.Rd
index f4228e2..ba6140f 100644
--- a/man/HTMLEnd.Rd
+++ b/man/HTMLEnd.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{HTMLEnd}
\alias{HTMLEnd}
@@ -9,7 +10,6 @@ HTMLEnd()
Ecrit le footer du fichier hTML
}
\details{
-Ecrit le footer du fichier initialise par HTMLInit, ouvre
-le fichier dans le navigateur et supprime l'acces.
+Ecrit le footer du fichier initialise par HTMLInit, ouvre le fichier dans le navigateur et supprime l'acces.
}
diff --git a/man/HTMLInit.Rd b/man/HTMLInit.Rd
index 016cdb6..ba5c4f8 100644
--- a/man/HTMLInit.Rd
+++ b/man/HTMLInit.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{HTMLInit}
\alias{HTMLInit}
@@ -7,20 +8,18 @@ HTMLInit(file = tempfile(pattern = "report", fileext = ".html"), title = "",
CSSfile = "")
}
\arguments{
- \item{file}{Nom du fichier HTML a creer, par defaut un
- fichier temporaire}
+\item{file}{Nom du fichier HTML a creer, par defaut un fichier temporaire}
- \item{title}{Titre de la page}
+\item{title}{Titre de la page}
- \item{CSSfile}{Fichier CSS a utiliser}
+\item{CSSfile}{Fichier CSS a utiliser}
}
\description{
Cree et remplit les headers pour un fichier hTML
}
\details{
-Si aucun nom de fichier n'est fourni, cree un fichier
-temporaire dans le repertoire temporaire Le nom du fichier
-actuel est stocke dans .HTML.file
+Si aucun nom de fichier n'est fourni, cree un fichier temporaire dans le repertoire temporaire
+Le nom du fichier actuel est stocke dans .HTML.file
}
\examples{
\dontrun{
diff --git a/man/charger.Rd b/man/charger.Rd
index aa3a27e..0d8ef78 100644
--- a/man/charger.Rd
+++ b/man/charger.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{charger}
\alias{charger}
@@ -6,32 +7,24 @@
charger(fichier, feuille = 1, chemin = "../../data/")
}
\arguments{
- \item{fichier}{Fichier de donnees a charger}
+\item{fichier}{Fichier de donnees a charger}
- \item{feuille}{Feuille a utiliser si fichier excel et en
- cas de feuilles mutiples (et qu'on veut acceder a une
- feuille au-dela de la premiere)}
+\item{feuille}{Feuille a utiliser si fichier excel et en cas de feuilles mutiples (et qu'on veut acceder a une feuille au-dela de la premiere)}
- \item{chemin}{Chemin ou trouver le fichier de donnees
- (par defaut ../../data/)}
+\item{chemin}{Chemin ou trouver le fichier de donnees (par defaut ../../data/)}
}
\value{
La data frame avec les labels et formats
}
\description{
-Charge un fichier texte ou excel contenant les donnees
-ainsi que les formats et labels
+Charge un fichier texte ou excel contenant les donnees ainsi que les formats et labels
}
\details{
-La fonction charge les donnees contenues dans le fichier de
-donnees et renvoie une table de valeurs. Si des
-labels/formats sont definis ils seront appliques (fichiers
-labels.sas, formats.sas et attribformats.sas) Les variables
-pour lesquelles un format est defini seront considerees
-comme des variables qualitatives. La table de valeurs prend
-automatiquement le nom du fichier (suffixe par le numero de
-feuille). Le fichier de donnees est charge depuis
-../../data/, les formats depuis le repertoire courant.
+La fonction charge les donnees contenues dans le fichier de donnees et renvoie une table de valeurs.
+Si des labels/formats sont definis ils seront appliques (fichiers labels.sas, formats.sas et attribformats.sas)
+Les variables pour lesquelles un format est defini seront considerees comme des variables qualitatives.
+La table de valeurs prend automatiquement le nom du fichier (suffixe par le numero de feuille).
+Le fichier de donnees est charge depuis ../../data/, les formats depuis le repertoire courant.
}
\examples{
\dontrun{Ma_table <- charger("donnees.xls", feuille=2)}
diff --git a/man/desc_global.Rd b/man/desc_global.Rd
index 68798c6..7a9a3f8 100644
--- a/man/desc_global.Rd
+++ b/man/desc_global.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{desc_global}
\alias{desc_global}
@@ -8,40 +9,31 @@ desc_global(table, html = "desc_global", titre = NULL, variables = NULL,
note = NULL, nbdec = 1)
}
\arguments{
- \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
- \item{html}{Nom du fichier html, par defaut
- "desc_global.html"}
+\item{html}{Nom du fichier html, par defaut "desc_global.html"}
- \item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Descriptif
- global de nom_de_la_table"}
+\item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Descriptif global de nom_de_la_table"}
- \item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire,
- par defaut toutes les variables contenues dans la table}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire, par defaut toutes les variables contenues dans la table}
- \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
- exclure de la description}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la description}
- \item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%,
- \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et
- max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
+\item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%, \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
- \item{miss}{Booleen : afficher ou non les valeurs
- manquantes, par defaut TRUE}
+\item{miss}{Booleen : afficher ou non les valeurs manquantes, par defaut TRUE}
- \item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
+\item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
- \item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par
- defaut 1}
+\item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par defaut 1}
}
\description{
Produit un tableau descriptif d'une table
}
\details{
-Permet de produire un tableau descriptif des variables
-contenues dans la table. Si les labels et formats sont
-definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
+Permet de produire un tableau descriptif des variables contenues dans la table.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
}
\examples{
\dontrun{
diff --git a/man/desc_groupe.Rd b/man/desc_groupe.Rd
index 4625a32..6bbec97 100644
--- a/man/desc_groupe.Rd
+++ b/man/desc_groupe.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{desc_groupe}
\alias{desc_groupe}
@@ -8,49 +9,36 @@ desc_groupe(table, groupe, param = character(0), html = NULL,
"\%/moy", "et"), note = NULL, nbdec = 1, pourcent = "total")
}
\arguments{
- \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
- \item{groupe}{Nom de la variable qualitative a utiliser
- pour la comparaison}
+\item{groupe}{Nom de la variable qualitative a utiliser pour la comparaison}
- \item{param}{Vecteur de noms de variables considerees
- comme parametriques}
+\item{param}{Vecteur de noms de variables considerees comme parametriques}
- \item{html}{Nom du fichier html, par defaut
- "desc_groupe_nomdelavariable.html"}
+\item{html}{Nom du fichier html, par defaut "desc_groupe_nomdelavariable.html"}
- \item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Comparaison
- selon nom_de_la_variable"}
+\item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Comparaison selon nom_de_la_variable"}
- \item{variables}{Vecteur de noms de variables a comparer,
- par defaut toutes les variables contenues dans la table
- moins celle servant de comparateur}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a comparer, par defaut toutes les variables contenues dans la table moins celle servant de comparateur}
- \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
- exclure de la comparaison #'}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la comparaison
+#'}
- \item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%,
- \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et
- max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
+\item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%, \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
- \item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
+\item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
- \item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par
- defaut 1}
+\item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par defaut 1}
- \item{pourcent}{Pourcentages pour les variables
- qualitatives, en colonnes ("col") ou en lignes ("row"),
- par defaut sur le total}
+\item{pourcent}{Pourcentages pour les variables qualitatives, en colonnes ("col") ou en lignes ("row"), par defaut sur le total}
}
\description{
Produit un tableau comparatif par groupe
}
\details{
-Permet de produire un tableau comparatif des variables
-contenues dans la table passee en parametre selon les
-modalites d'une d'entre elles. Si les labels et formats
-sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
+Permet de produire un tableau comparatif des variables contenues dans la table passee en parametre selon les modalites d'une d'entre elles.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
}
\examples{
\dontrun{
diff --git a/man/diagnostic.Rd b/man/diagnostic.Rd
index dfcccf0..2a5cdf2 100644
--- a/man/diagnostic.Rd
+++ b/man/diagnostic.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{diagnostic}
\alias{diagnostic}
@@ -6,32 +7,23 @@
diagnostic(table, variables = NULL, variables_neg = NULL)
}
\arguments{
- \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
- \item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire,
- par defaut toutes les variables contenues dans la table}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire, par defaut toutes les variables contenues dans la table}
- \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
- exclure de la description}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la description}
}
\value{
-Un vecteur contenant les variables considerees comme
-parametriques
+Un vecteur contenant les variables considerees comme parametriques
}
\description{
-Produit un tableau descriptif de la table et des graphiques
-pour la verification des conditions d'utilisation des tests
-satistiques
+Produit un tableau descriptif de la table et des graphiques pour la verification des conditions d'utilisation des tests satistiques
}
\details{
-Permet de produire un tableau descriptif des variables
-contenues dans la table. Si les labels et formats sont
-definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. La fonction renvoie un vecteur de noms de
-variables considerees comme parametriques apres un test de
-normalite de Shapiro-Wilk. Le fichier est cree dans le
-repertoire temporaire. Il est possible de le sauvegarder
-avec ses graphiques a partir du navigateur.
+Permet de produire un tableau descriptif des variables contenues dans la table.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+La fonction renvoie un vecteur de noms de variables considerees comme parametriques apres un test de normalite de Shapiro-Wilk.
+Le fichier est cree dans le repertoire temporaire. Il est possible de le sauvegarder avec ses graphiques a partir du navigateur.
}
\examples{
\dontrun{
diff --git a/man/label.Rd b/man/label.Rd
index 6fff698..0255d8a 100644
--- a/man/label.Rd
+++ b/man/label.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{label}
\alias{label}
@@ -18,21 +19,19 @@ label(objet) <- value
\method{label}{data.frame}(objet) <- value
}
\arguments{
- \item{objet}{L'objet a nommer}
+\item{objet}{L'objet a nommer}
- \item{value}{Le texte de l'etiquette}
+\item{value}{Le texte de l'etiquette}
}
\value{
-Renvoie une chaine de caracteres contenant l'etiquette de
-l'objet
+Renvoie une chaine de caracteres contenant l'etiquette de l'objet
}
\description{
Attribuer ou recuperer l'etiquette d'un objet
}
\details{
-Methode par defaut pour acceder et modifier l'etiquette
-d'un objet ou d'un element d'un objet. Il est possible de
-supprimer l'etiquette en passant NULL a la fonction.
+Methode par defaut pour acceder et modifier l'etiquette d'un objet ou d'un element d'un objet.
+Il est possible de supprimer l'etiquette en passant NULL a la fonction.
}
\examples{
a <- c(18,25,23,32)
diff --git a/man/loadFormatsFromFile.Rd b/man/loadFormatsFromFile.Rd
index c68ebfa..ecff678 100644
--- a/man/loadFormatsFromFile.Rd
+++ b/man/loadFormatsFromFile.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{loadFormatsFromFile}
\alias{loadFormatsFromFile}
@@ -6,33 +7,30 @@
loadFormatsFromFile(dataframe, file_format, file_attrib)
}
\arguments{
- \item{dataframe}{The dataframe to which you want to
- assign labels}
+\item{dataframe}{The dataframe to which you want to assign labels}
- \item{file}{The flat file from which to load the label
- data}
+\item{file}{The flat file from which to load the label data}
}
\value{
The dataframe with label attributes
}
\description{
-Loads factor levels from flat files and applies them to the
-provided dataframe
+Loads factor levels from flat files and applies them to the provided dataframe
}
\details{
-This function takes a dataframe and assigns factor levels
-to the corresponding variables. Two files must be provided
-: One describing the formats to be used (permitting the
-re-use of a defined format), which must be formatted like
-so: value format_name value0_in_data_frame = 'Label for
-level 0' value1_in_data_frame = "Label for level 1" and so
-on. As shown, both single and double quotes are accepted.
-The value before the equal sign can be numeric (categorical
-coding) or text for recoding. The other file assigns
-defined formats to variables in the dataframe. It must be
-formatted like so: var1 var2 var3 varN format=format_name
-with one line for every assigned format. As always, be
-careful of the case sensitiveness.
+This function takes a dataframe and assigns factor levels to the corresponding variables.
+Two files must be provided :
+One describing the formats to be used (permitting the re-use of a defined format), which must be formatted like so:
+value format_name
+ value0_in_data_frame = 'Label for level 0'
+ value1_in_data_frame = "Label for level 1"
+and so on.
+As shown, both single and double quotes are accepted.
+The value before the equal sign can be numeric (categorical coding) or text for recoding.
+The other file assigns defined formats to variables in the dataframe. It must be formatted like so:
+var1 var2 var3 varN format=format_name
+with one line for every assigned format.
+As always, be careful of the case sensitiveness.
}
\examples{
\dontrun{df <- loadFormatsFromFile(df,"formats.txt","attribformats.txt")}
diff --git a/man/loadLabelsFromFile.Rd b/man/loadLabelsFromFile.Rd
index 2fc891b..9853a02 100644
--- a/man/loadLabelsFromFile.Rd
+++ b/man/loadLabelsFromFile.Rd
@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
\encoding{UTF-8}
\name{loadLabelsFromFile}
\alias{loadLabelsFromFile}
@@ -6,25 +7,22 @@
loadLabelsFromFile(dataframe, file)
}
\arguments{
- \item{dataframe}{The dataframe to which you want to
- assign labels}
+\item{dataframe}{The dataframe to which you want to assign labels}
- \item{file}{The flat file from which to load the label
- data}
+\item{file}{The flat file from which to load the label data}
}
\value{
The dataframe with label attributes
}
\description{
-Loads label values from a flat file and applies them to the
-provided dataframe
+Loads label values from a flat file and applies them to the provided dataframe
}
\details{
-This function takes a dataframe and adds label attributes
-to the variables. The file must be formatted like so :
-variablename = "Label for the variable" with one line per
-variable As always, be careful of the case sensitiveness
-and the use of double quotes !
+This function takes a dataframe and adds label attributes to the variables.
+The file must be formatted like so :
+variablename = "Label for the variable"
+with one line per variable
+As always, be careful of the case sensitiveness and the use of double quotes !
}
\examples{
\dontrun{df <- loadLabelsFromFile(df,"labels.txt")}