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Correction pour nombre de RSS manquants

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Maxime Wack 7 years ago
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@@ -28,7 +28,7 @@ getOvalide(CHUuser, CHUpass, annee, mois)
print(str_c("3/9 - Téléchargement du tableau de", mois, annee - 1, sep = " "))
getOvalide(CHUuser, CHUpass, annee - 1, mois)

# Extraction des données des fichiers ePMSI
# Extraction des données des fichiers ePMSI ----
print("4/9 - Extraction des tableaux ePMSI")
read.csv2("listOvalide.csv") %>%
{
@@ -119,7 +119,7 @@ exhau_pims %<>%
filter(month(Sortie) <= mois)

dbConnect(MySQL(), host = "localhost", dbname = "pmsi_dim", user = user, password = password) %>%
dbWriteTable("exhaustivite", data.frame(annee = annee, mois = mois, nb_rss_tot = exhau_pims %>% distinct(RSS, .keep_all = T) %>% nrow, nb_rss_manq = exhau_pims %>% distinct(RSS, .keep_all = T) %>% filter(is.na(DP)) %>% nrow), row.names = F, append = T)
dbWriteTable("exhaustivite", data.frame(annee = annee, mois = mois, nb_rss_tot = exhau_pims %>% distinct(RSS, .keep_all = T) %>% nrow, nb_rss_manq = exhau_pims %>% filter(is.na(DP)) %>% distinct(RSS) %>% nrow), row.names = F, append = T)

an <- annee



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