Summary in diagnostic corrected : Dates now work, and the code is simpler !

NAMESPACE

@@ -1,3 +1,5 @@
+# Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
+
 S3method("label<-",data.frame)
 S3method("label<-",default)
 S3method(label,default)

R/desc_global.R

@@ -248,10 +248,7 @@ diagnostic <- function(table, variables=NULL, variables_neg=NULL)
         inc()
         HTML("<tr>", paste("<th>", names(summary(table[[var]])), "</th>", collapse=""), "</tr>")
         HTML("<tr>", sep="")
-        for (valeur in summary(table[[var]]))
-        {
-          HTML("<td>", valeur, "</td>", sep="")
-        }
+        HTML("<td>",summary(table[[var]]),"</td>",sep="")
         HTML("</tr>")
         dec()
         HTML("</table>")

man/HTML.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{HTML}
 \alias{HTML}
@@ -6,21 +7,18 @@
 HTML(x, ..., append = T, sep = "\\n")
 }
 \arguments{
-  \item{x}{Contenu a ecrire}
+\item{x}{Contenu a ecrire}
 
-  \item{...}{Contenu concatene sans espace a x}
+\item{...}{Contenu concatene sans espace a x}
 
-  \item{append}{Decide si x... doit etre ajoute a un
-  fichier existant}
+\item{append}{Decide si x... doit etre ajoute a un fichier existant}
 
-  \item{sep}{Separateur de fin de ligne, modifier pour
-  ecrire sur la meme ligne du fichier}
+\item{sep}{Separateur de fin de ligne, modifier pour ecrire sur la meme ligne du fichier}
 }
 \description{
 Ecrit dans le fichier HTML cree par HTMLInit
 }
 \details{
-Ecrit dans le fichier initialise par HTMLInit dont le nom
-est contenu dans .HTML.file
+Ecrit dans le fichier initialise par HTMLInit dont le nom est contenu dans .HTML.file
 }
 

man/HTMLEnd.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{HTMLEnd}
 \alias{HTMLEnd}
@@ -9,7 +10,6 @@ HTMLEnd()
 Ecrit le footer du fichier hTML
 }
 \details{
-Ecrit le footer du fichier initialise par HTMLInit, ouvre
-le fichier dans le navigateur et supprime l'acces.
+Ecrit le footer du fichier initialise par HTMLInit, ouvre le fichier dans le navigateur et supprime l'acces.
 }
 

man/HTMLInit.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{HTMLInit}
 \alias{HTMLInit}
@@ -7,20 +8,18 @@ HTMLInit(file = tempfile(pattern = "report", fileext = ".html"), title = "",
   CSSfile = "")
 }
 \arguments{
-  \item{file}{Nom du fichier HTML a creer, par defaut un
-  fichier temporaire}
+\item{file}{Nom du fichier HTML a creer, par defaut un fichier temporaire}
 
-  \item{title}{Titre de la page}
+\item{title}{Titre de la page}
 
-  \item{CSSfile}{Fichier CSS a utiliser}
+\item{CSSfile}{Fichier CSS a utiliser}
 }
 \description{
 Cree et remplit les headers pour un fichier hTML
 }
 \details{
-Si aucun nom de fichier n'est fourni, cree un fichier
-temporaire dans le repertoire temporaire Le nom du fichier
-actuel est stocke dans .HTML.file
+Si aucun nom de fichier n'est fourni, cree un fichier temporaire dans le repertoire temporaire
+Le nom du fichier actuel est stocke dans .HTML.file
 }
 \examples{
 \dontrun{

man/charger.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{charger}
 \alias{charger}
@@ -6,32 +7,24 @@
 charger(fichier, feuille = 1, chemin = "../../data/")
 }
 \arguments{
-  \item{fichier}{Fichier de donnees a charger}
+\item{fichier}{Fichier de donnees a charger}
 
-  \item{feuille}{Feuille a utiliser si fichier excel et en
-  cas de feuilles mutiples (et qu'on veut acceder a une
-  feuille au-dela de la premiere)}
+\item{feuille}{Feuille a utiliser si fichier excel et en cas de feuilles mutiples (et qu'on veut acceder a une feuille au-dela de la premiere)}
 
-  \item{chemin}{Chemin ou trouver le fichier de donnees
-  (par defaut ../../data/)}
+\item{chemin}{Chemin ou trouver le fichier de donnees (par defaut ../../data/)}
 }
 \value{
 La data frame avec les labels et formats
 }
 \description{
-Charge un fichier texte ou excel contenant les donnees
-ainsi que les formats et labels
+Charge un fichier texte ou excel contenant les donnees ainsi que les formats et labels
 }
 \details{
-La fonction charge les donnees contenues dans le fichier de
-donnees et renvoie une table de valeurs. Si des
-labels/formats sont definis ils seront appliques (fichiers
-labels.sas, formats.sas et attribformats.sas) Les variables
-pour lesquelles un format est defini seront considerees
-comme des variables qualitatives. La table de valeurs prend
-automatiquement le nom du fichier (suffixe par le numero de
-feuille). Le fichier de donnees est charge depuis
-../../data/, les formats depuis le repertoire courant.
+La fonction charge les donnees contenues dans le fichier de donnees et renvoie une table de valeurs.
+Si des labels/formats sont definis ils seront appliques (fichiers labels.sas, formats.sas et attribformats.sas)
+Les variables pour lesquelles un format est defini seront considerees comme des variables qualitatives.
+La table de valeurs prend automatiquement le nom du fichier (suffixe par le numero de feuille).
+Le fichier de donnees est charge depuis ../../data/, les formats depuis le repertoire courant.
 }
 \examples{
 \dontrun{Ma_table <- charger("donnees.xls", feuille=2)}

man/desc_global.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{desc_global}
 \alias{desc_global}
@@ -8,40 +9,31 @@ desc_global(table, html = "desc_global", titre = NULL, variables = NULL,
   note = NULL, nbdec = 1)
 }
 \arguments{
-  \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
 
-  \item{html}{Nom du fichier html, par defaut
-  "desc_global.html"}
+\item{html}{Nom du fichier html, par defaut "desc_global.html"}
 
-  \item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Descriptif
-  global de nom_de_la_table"}
+\item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Descriptif global de nom_de_la_table"}
 
-  \item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire,
-  par defaut toutes les variables contenues dans la table}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire, par defaut toutes les variables contenues dans la table}
 
-  \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
-  exclure de la description}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la description}
 
-  \item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%,
-  \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et
-  max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
+\item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%, \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
 
-  \item{miss}{Booleen : afficher ou non les valeurs
-  manquantes, par defaut TRUE}
+\item{miss}{Booleen : afficher ou non les valeurs manquantes, par defaut TRUE}
 
-  \item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
+\item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
 
-  \item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par
-  defaut 1}
+\item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par defaut 1}
 }
 \description{
 Produit un tableau descriptif d'une table
 }
 \details{
-Permet de produire un tableau descriptif des variables
-contenues dans la table. Si les labels et formats sont
-definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
+Permet de produire un tableau descriptif des variables contenues dans la table.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
 }
 \examples{
 \dontrun{

man/desc_groupe.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{desc_groupe}
 \alias{desc_groupe}
@@ -8,49 +9,36 @@ desc_groupe(table, groupe, param = character(0), html = NULL,
   "\%/moy", "et"), note = NULL, nbdec = 1, pourcent = "total")
 }
 \arguments{
-  \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
 
-  \item{groupe}{Nom de la variable qualitative a utiliser
-  pour la comparaison}
+\item{groupe}{Nom de la variable qualitative a utiliser pour la comparaison}
 
-  \item{param}{Vecteur de noms de variables considerees
-  comme parametriques}
+\item{param}{Vecteur de noms de variables considerees comme parametriques}
 
-  \item{html}{Nom du fichier html, par defaut
-  "desc_groupe_nomdelavariable.html"}
+\item{html}{Nom du fichier html, par defaut "desc_groupe_nomdelavariable.html"}
 
-  \item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Comparaison
-  selon nom_de_la_variable"}
+\item{titre}{Titre du tableau, par defaut "Comparaison selon nom_de_la_variable"}
 
-  \item{variables}{Vecteur de noms de variables a comparer,
-  par defaut toutes les variables contenues dans la table
-  moins celle servant de comparateur}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a comparer, par defaut toutes les variables contenues dans la table moins celle servant de comparateur}
 
-  \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
-  exclure de la comparaison #'}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la comparaison
+#'}
 
-  \item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%,
-  \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et
-  max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
+\item{stats}{Vecteur de valeurs a calculer, parmi N, \%, \%/moy, moy, \%/med, med, et, ic95, Q1, med, Q3, min et max. Par defaut c("N","\%/moy","et")}
 
-  \item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
+\item{note}{Note de bas de page, par defaut vide}
 
-  \item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par
-  defaut 1}
+\item{nbdec}{Nombre de decimales apres la virgule, par defaut 1}
 
-  \item{pourcent}{Pourcentages pour les variables
-  qualitatives, en colonnes ("col") ou en lignes ("row"),
-  par defaut sur le total}
+\item{pourcent}{Pourcentages pour les variables qualitatives, en colonnes ("col") ou en lignes ("row"), par defaut sur le total}
 }
 \description{
 Produit un tableau comparatif par groupe
 }
 \details{
-Permet de produire un tableau comparatif des variables
-contenues dans la table passee en parametre selon les
-modalites d'une d'entre elles. Si les labels et formats
-sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
+Permet de produire un tableau comparatif des variables contenues dans la table passee en parametre selon les modalites d'une d'entre elles.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+Le fichier de sortie est place dans ../HTML Output
 }
 \examples{
 \dontrun{

man/diagnostic.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{diagnostic}
 \alias{diagnostic}
@@ -6,32 +7,23 @@
 diagnostic(table, variables = NULL, variables_neg = NULL)
 }
 \arguments{
-  \item{table}{Table a utiliser}
+\item{table}{Table a utiliser}
 
-  \item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire,
-  par defaut toutes les variables contenues dans la table}
+\item{variables}{Vecteur de noms de variables a decrire, par defaut toutes les variables contenues dans la table}
 
-  \item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a
-  exclure de la description}
+\item{variables_neg}{Vecteur de noms de variables a exclure de la description}
 }
 \value{
-Un vecteur contenant les variables considerees comme
-parametriques
+Un vecteur contenant les variables considerees comme parametriques
 }
 \description{
-Produit un tableau descriptif de la table et des graphiques
-pour la verification des conditions d'utilisation des tests
-satistiques
+Produit un tableau descriptif de la table et des graphiques pour la verification des conditions d'utilisation des tests satistiques
 }
 \details{
-Permet de produire un tableau descriptif des variables
-contenues dans la table. Si les labels et formats sont
-definis et charges ils seront utilises pour peupler le
-tableau. La fonction renvoie un vecteur de noms de
-variables considerees comme parametriques apres un test de
-normalite de Shapiro-Wilk. Le fichier est cree dans le
-repertoire temporaire. Il est possible de le sauvegarder
-avec ses graphiques a partir du navigateur.
+Permet de produire un tableau descriptif des variables contenues dans la table.
+Si les labels et formats sont definis et charges ils seront utilises pour peupler le tableau.
+La fonction renvoie un vecteur de noms de variables considerees comme parametriques apres un test de normalite de Shapiro-Wilk.
+Le fichier est cree dans le repertoire temporaire. Il est possible de le sauvegarder avec ses graphiques a partir du navigateur.
 }
 \examples{
 \dontrun{

man/label.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{label}
 \alias{label}
@@ -18,21 +19,19 @@ label(objet) <- value
 \method{label}{data.frame}(objet) <- value
 }
 \arguments{
-  \item{objet}{L'objet a nommer}
+\item{objet}{L'objet a nommer}
 
-  \item{value}{Le texte de l'etiquette}
+\item{value}{Le texte de l'etiquette}
 }
 \value{
-Renvoie une chaine de caracteres contenant l'etiquette de
-l'objet
+Renvoie une chaine de caracteres contenant l'etiquette de l'objet
 }
 \description{
 Attribuer ou recuperer l'etiquette d'un objet
 }
 \details{
-Methode par defaut pour acceder et modifier l'etiquette
-d'un objet ou d'un element d'un objet. Il est possible de
-supprimer l'etiquette en passant NULL a la fonction.
+Methode par defaut pour acceder et modifier l'etiquette d'un objet ou d'un element d'un objet.
+Il est possible de supprimer l'etiquette en passant NULL a la fonction.
 }
 \examples{
 a <- c(18,25,23,32)

man/loadFormatsFromFile.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{loadFormatsFromFile}
 \alias{loadFormatsFromFile}
@@ -6,33 +7,30 @@
 loadFormatsFromFile(dataframe, file_format, file_attrib)
 }
 \arguments{
-  \item{dataframe}{The dataframe to which you want to
-  assign labels}
+\item{dataframe}{The dataframe to which you want to assign labels}
 
-  \item{file}{The flat file from which to load the label
-  data}
+\item{file}{The flat file from which to load the label data}
 }
 \value{
 The dataframe with label attributes
 }
 \description{
-Loads factor levels from flat files and applies them to the
-provided dataframe
+Loads factor levels from flat files and applies them to the provided dataframe
 }
 \details{
-This function takes a dataframe and assigns factor levels
-to the corresponding variables. Two files must be provided
-: One describing the formats to be used (permitting the
-re-use of a defined format), which must be formatted like
-so: value format_name value0_in_data_frame = 'Label for
-level 0' value1_in_data_frame = "Label for level 1" and so
-on. As shown, both single and double quotes are accepted.
-The value before the equal sign can be numeric (categorical
-coding) or text for recoding. The other file assigns
-defined formats to variables in the dataframe. It must be
-formatted like so: var1 var2 var3 varN format=format_name
-with one line for every assigned format. As always, be
-careful of the case sensitiveness.
+This function takes a dataframe and assigns factor levels to the corresponding variables.
+Two files must be provided :
+One describing the formats to be used (permitting the re-use of a defined format), which must be formatted like so:
+value format_name
+   value0_in_data_frame = 'Label for level 0'
+   value1_in_data_frame = "Label for level 1"
+and so on.
+As shown, both single and double quotes are accepted.
+The value before the equal sign can be numeric (categorical coding) or text for recoding.
+The other file assigns defined formats to variables in the dataframe. It must be formatted like so:
+var1 var2 var3 varN format=format_name
+with one line for every assigned format.
+As always, be careful of the case sensitiveness.
 }
 \examples{
 \dontrun{df <- loadFormatsFromFile(df,"formats.txt","attribformats.txt")}

man/loadLabelsFromFile.Rd

@@ -1,3 +1,4 @@
+% Generated by roxygen2 (4.0.1): do not edit by hand
 \encoding{UTF-8}
 \name{loadLabelsFromFile}
 \alias{loadLabelsFromFile}
@@ -6,25 +7,22 @@
 loadLabelsFromFile(dataframe, file)
 }
 \arguments{
-  \item{dataframe}{The dataframe to which you want to
-  assign labels}
+\item{dataframe}{The dataframe to which you want to assign labels}
 
-  \item{file}{The flat file from which to load the label
-  data}
+\item{file}{The flat file from which to load the label data}
 }
 \value{
 The dataframe with label attributes
 }
 \description{
-Loads label values from a flat file and applies them to the
-provided dataframe
+Loads label values from a flat file and applies them to the provided dataframe
 }
 \details{
-This function takes a dataframe and adds label attributes
-to the variables. The file must be formatted like so :
-variablename = "Label for the variable" with one line per
-variable As always, be careful of the case sensitiveness
-and the use of double quotes !
+This function takes a dataframe and adds label attributes to the variables.
+The file must be formatted like so :
+variablename = "Label for the variable"
+with one line per variable
+As always, be careful of the case sensitiveness and the use of double quotes !
 }
 \examples{
 \dontrun{df <- loadLabelsFromFile(df,"labels.txt")}